Quelles valeurs partager et transmettre aujourd’hui ?, Paris, éd. Albin Michel, octobre 2016, 272 p.

Les Tisserands, Paris, éd. Les liens qui libèrent, mai 2016, 192 p.

Lettre ouverte au monde musulman, Paris, éd. Les liens qui libèrent,‎ avril 2015, 64 p.

Plaidoyer pour la fraternité, Paris, éd. Albin Michel,‎ février 2015, 112 p.

Histoire de l’humanisme en Occident, Paris, éd. Armand Colin, coll. « Le temps des idées »,‎ août 2014, 288 p.

Comment sortir de la religion, Paris, éd. La Découverte, coll. « Les Empêcheurs de penser en rond »,‎ avril 2012, 237 p.

L’islam face à la mort de Dieu : Actualité de Mohammed Iqbal, Paris, Éditions François Bourin, coll. « L’Actualité »,‎ 2010, 320 p.

L’islam sans soumission : Pour un existentialisme musulman, Paris, éd. Albin Michel, coll. « L’islam des lumières »,‎ octobre 2008, 288 p. / Réédition en livre de poche,  Paris, éd. Albin Michel, coll. « Espaces Libres »,‎ 2012, 279 p.

Self islam : Histoire d’un islam personnel, Paris, Éditions du Seuil, coll. « Non conforme »,‎ 2006, 250 p.

Un Islam pour notre temps, Paris, Éditions du Seuil, coll. « La couleur des idées »,‎ 2004, 120 p.

Pour une pédagogie de la laïcité à l’école, Paris, La Documentation française,‎ 2012, 142 p.